由于肿胀或水肿的鼻粘膜阻塞了在中鼻道和上鼻道的鼻窦开口所致。几乎所有的过敏性鼻炎患者均有不同程度的过敏性鼻窦炎，受侵的鼻窦常为双侧或全鼻窦。过敏性鼻炎在没有继发感染前，常无明显的临床表现，诊断依靠鼻窦X线摄片或CT扫描。

鼻窦炎是指鼻窦黏膜的发炎，多由于鼻窦的黏膜纤毛清除分泌物的功能破坏所造成，鼻窦开口的阻塞则是此病理变化中关键的一环，而鼻窦开口的阻塞，则以上呼吸道感染、过敏性鼻炎和鼻息肉为最常见的病因，由此可知过敏性鼻炎和鼻窦炎实存在有密切的关系了。

鼻窦炎的病人临床上可见到，病人在上呼吸道感染后7至10天后，鼻塞、咳嗽的症状持续存在。在儿科的病人，因为对鼻腔分泌物的处理能力较差，常会出现鼻涕倒流的现象，症状尤其以夜咳为主，鼻水可以是清澈或黄脓样，而发烧、鼻窦不舒服或头痛则较少。在理学检查上可见到充血而且肿胀的鼻黏膜，有时也可见到脓性鼻漏，特别要注意的是在过敏性鼻炎合并鼻窦炎的病人身上，可能因此使得过敏性鼻炎的鼻腔黏膜表现变得不明显。